KLEBSİELLA PNEUMONİAE, PSEUDOMONAS AERUGİNOSA,ACİNETOBACTER BAUMANNİİ SUŞLARINDA KOLİSTİN SIVI DİSK ELÜSYON, KOLİSTİN AGAR TEST, SIVI MİKRODİLÜSYON YÖNTEMLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI VE MCR-1 GENİNİN ARAŞTIRILMASI

Abstract

Kolistin duyarlılığı tayini için referans yöntem olan sıvı mikrodilüsyon (SMD) yöntemine alternatif olarak kolistin sıvı disk elüsyon (KSDE) ve kolistin agar test (KAT) yöntemleri geliştirilmiştir. Bu çalışmadaki amacımız, Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae), Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), ve Acinetobacter baumannii (A. baumannii), suşlarında kolistin duyarlılığını belirlemek için SMD, KSDE ve KAT yöntemlerini karşılaştırmak; kolistin dirençli izolatlarda mcr-1 (mobil kolistin direnci) direnç geninin polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi ile araştırılmasıdır. Çalışmaya 62 K. pneumoniae, 52 P. aeruginosa ve 62 A. baumannii olmak üzere toplam 176 izolat dahil edilmiştir. Kolistin duyarlılığı tespitinde SMD, KSDE ve KAT yöntemleri kullanılmış ve herhangi birinde kolistin dirençli bulunan izolatlardan genetik materyal izolasyonu yapılıp PCR uygulanmıştır. Veriler değerlendirildiğinde K. pneumoniae'da; KSDE yöntemi için kategorik uyum (KU), temel uyum (TU), büyük hata (BH) ve çok büyük hata (ÇBH) oranları sırasıyla %93.5, %91.9, %13.3 ve %0 bulunurken KAT yöntemi için KU ve TU oranları %96, ÇBH %6.2 saptanmış olup BH gözlenmemiştir. Referans yönteme göre P. aeruginosa'da iki yöntemde de KU, TU, BH ve ÇBH oranları kabul edilebilir sınırlarda bulunmuştur. Son olarak A. baumannii'de; KSDE yöntemi için KU %83.8, TU %80.6, BH %11.7 ve ÇBH %36.3 bulunurken KAT yöntemi için KU ve TU %88, BH %2 ve ÇBH %54 bulunmuştur. Herhangi bir yöntemle kolistin dirençli bulunan 58 izolatta mcr-1 geni saptanmamıştır. Kolistin duyarlılık tespiti için KSDE ve KAT yöntemlerinin K. pneumoniae'da ve P. aeruginosa'da SMD yöntemine alternatif olarak kullanılabileceği düşünülürken A. baumannii için bu yöntemlerin kullanılmasının hatalı sonuçlara neden olacağı düşünülmektedir.