Echinococcus granulosus sensu stricto İçindeki Genetik Varyasyonun Mitokondriyal Sitokrom Oksidaz b (mt-cytb) Gen Sekansları Kullanılarak İn Silico Yöntemle Analiz Edilmesi

Abstract

Echinococcus granulosus sensu lato (s.l.), kistik ekinokokozise (KE) neden olan, yaşam döngüleri ve konak seçimleri açısından farklılıklar gösteren ve dünya çapında öneme sahip zoonotik bir tür kompleksidir. Bu çalışmada, dünyanın farklı yerlerinden GenBank'ta kayıt altına alınan E. granulosus sensu stricto (s.s.) izolatlarının mitokondriyal sitokrom oksidaz b (mt-cytb) dizilimi kullanılarak haplotip çeşitliliği, genetik varyasyonu ve popülasyon yapısı araştırılmıştır. Bu amaçla cytb genine ait 26 farklı lokasyondan ve 12 farklı konak türüne ait 418 gen dizisi analizlere dahil edildi. Cytb gen dizisinde 114 farklı noktada mutasyon gözlendi ve 102 haplotip tanımlandı. Tajima's D, Fu's Fs ve Fu’s LD değerleri anlamlı ve yüksek negatif değerler gösterdi. Analiz edilen dizilerde haplotip farklılıkları olduğu ve oluşturulan alt popülasyonlar arasında genetik varyasyonunun olduğu gösterildi. Bu çalışmanın, E. granulosus s.s.’nin dünya çapındaki epidemiyolojisi, coğrafi dağılımı ve cytb genine dayalı popülasyon yapısı hakkında büyük ölçekli çalışmalara temel teşkil edebileceği düşünülmektedir.