PLASMODİUM FALCİPARUM'DA LAKTAT DEHİDROGENAZ ENZİMİNİN AKTİF BÖLGE HALKASI AMİNO ASİTLERİNİN SİTE-DİRECTED MUTAGENEZ ÇALIŞMALARI İLE ANALİZİ

Abstract

YÜKSEK LİSANS TEZİ Plasmodium falciparum' An LAKTAT DEHIDROGENAZ ENZİMİNİN AKTİF BÖLGE HALKASI AMİNO ASİTLERİNİN SITE-DIRECTED MUTAGENEZ ÇALIŞMALARI İLE ANALİZİ Venhar ÇELİK Fırat Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Anabilim Dalı 2004, Sayfa : 53 Mevcut antimalariallara karşı direncin ortaya çıkması yeni ilaçların geliştirilmesini gerekli kılmıştır. Bu tez çalışmasında, sıtmaya karşı etkin olacak yeni ilaç tasarım çalışmalarına sağlayacağı katkıyı test edebilmek için, hedef olarak seçilen Plasmodium falciparum 'un laktat dehidrogenaz (P/LDH) enziminin aktif bölge halkasındaki ilave 5 amino asidin delesyonu ile meydana gelebilecek yapısal değişikliğe proteinin ne kadar toleranslı olduğu araştırılmıştır. P/LDH'm aktif bölge halkasındaki ilave 5 amino asidin delesyonu beş aşamada gerçekleştirilmiştir. Her aşamada bir önceki aşamaya göre bir amino asit kısaltılmıştır. Yapılan çalışmalar sonrasında, P/LDH'ın bu bölgede en fazla iki amino asit delesyonuna dayanıklı olduğu fakat daha fazla amino asit delesyonunu kabul etmediğini göstermiştir. Buna göre P/LDH, aktif bölge halkasındaki küçük delesyonlara dayanıklı olmakla beraber bu bölgenin tamamen çıkarılması proteini inaktif hale getirmektedir. Elde edilen bu sonuçlar dikkate alınarak P/LDH ve insan LDH'ı arasında yüksek seçicilik gösteren inhibitörler bulunabileceği ve P/LDH'ın duyarlı olduğu aktif bölge halkasındaki bu değişikliklerin bileşiklere karşı direncin gelişmesine bir engel oluşturacağı düşünülmektedir. Anahtar Kelimeler: Sıtma, Plasmodium falciparum, Laktat dehidrogenaz, Yönlendirilmiş mutagenez. VIII