Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis of Escherichia coli ısolated from chickens

Abstract

Bu çalışmada, colibacillosis şüpheli farklı kanatlı işletmelerinden 48 E.coli suşu izole ve identifiye edildi. Suşların kanlı agara ekimleri yapıldıktan sonra, EMB ve MacConkey agara ekimleri yapıldı.110 örneğin bakteriyel kültürü sonucunda 48 (%13,6)’i E.coli olarak identifiye edildi. Bu bölgedeki E.coli soyları arasındaki genetik farklılıkları tespit etmek için RAPD metodu uygulandı. 48 E.coli izolatından ekstrakte edilen DNA’lar RAPD primer (COL 1) ile çoğaltıldı. RAPD analizinden dokuz farklı profil elde edildi. Bu sonuçlar bu bölgedeki E.coli soyları arasında büyük bir genetik farklılık olduğunu gösterdi. RAPD metodunun E.coli soylarını tiplendirmede yüksek oranda ayırıcı olduğu görüldü. Sonuç olarak bu çalışma; RAPD metodunun hem kolay hem de daha hızlı olmasından ötürü, E.coli’nin moleküler epidemiyolojisinin çalışılmasında, yüksek oranda etkili bir metod olduğunu gösterdi.